Paul Berthoud nacque nel Canton Vaud in Svizzera, fu un missionario e un linguista Tsonga e Ronga. Dopo la sua formazione nella facoltà di teologia della Chiesa libera di Vaud a Losanna, Svizzera, trascorse due anni a Edimburgo per studiare medicina e inglese. Lui e Ernest Creux (un compagno di studi in teologia) e le loro mogli arrivarono a Morija, Lesotho, nel febbraio 1873 per lavorare sotto la direzione della Missione Evangelica di Parigi nella stazione Hermon. Furono i primi missionari delle chiese della Svizzera francese (La Suisse Romande). Nel 1875 si trasferirono nel Transvaal e stabilirono la missione di Valdezia a Spelonken. Nonostante l'opposizione del presidente T.F. Burgers e del suo governo, il loro lavoro andò bene e Berthoud divenne noto per le sue capacità mediche sia tra la popolazione indigena che tra gli agricoltori bianchi.  Insieme al collega Ernest Creux fu chiamato dal Sinodo della Chiesa Libera del Cantone di Vaud a fondare la Missione Svizzera dell'Africa del Sud. Dopo la morte di sua moglie Eugenie e dei loro tre figli a causa della malaria nel 1879, tornò in Svizzera in licenza nel 1880-1884 e sposò la sua seconda moglie, Ruth Junod, sorella di H.A. Junod*. Nel 1887, dopo qualche altro anno a Spelonken, fondò la stazione di missione Rikatla sul piano costiero del Mozambico. Altre stazioni seguirono presto, tra cui una a Lourenco Marques (oggi Maputo). Berthoud visitò nuovamente la Svizzera dal 1894 al 1896. La sua seconda moglie morì nel 1901, e lui si ritirò in Svizzera nel 1903. Nonostante la sua cattiva salute tornò a Maputo nel 1906 per assistere la missione e trascorse la maggior parte del 1907-1909 nelle missioni di Rikatla e Tembe. Visitò nuovamente la Svizzera nel 1913-1914. Gli sopravisse la sua terza moglie, Emma Mathilda Schlub.

 

Le numerose pubblicazioni di Berthoud tra il 1883 e il 1929 comprendono principalmente traduzioni bibliche, inni e studi grammaticali di Gwamba (Tsonga) e Ronga. Fu un pioniere nello studio di queste due lingue e i suoi contributi linguistici alla letteratura Tsonga furono di particolare importanza.

 

Il suo primo contributo alla scienza consisteva in osservazioni sulla geografia e la geologia dell'Africa meridionale. Queste osservazioni furono estratte dalle sue lettere e pubblicate da E. Renevier come "Remarques geographiques et geologiques sur le Sud de l'Afrique" nel Bulletin de la Societe des Sciences Naturelles (Losanna, 1874-1875). Più importanti furono le sue osservazioni meteorologiche sistematiche a Maputo dal 1890 al 1901. Queste furono riassunte in una serie di circa 20 note nel Boletin da Sociedade de Geographia de Lisboa (1902-1906, Vol. 20-24). Le tabelle di accompagnamento contengono osservazioni triorarie diurne di temperatura dell'aria, umidità, velocità del vento, direzione del vento, nuvolosità e precipitazioni, per il periodo da luglio 1899 a dicembre 1901; i valori medi annuali per il 1890-1901 sono dati nelle ultime due note. In un breve articolo sulla stessa rivista nel 1902 ha confrontato le sue osservazioni per i tre mesi dal novembre 1898 al gennaio 1899 con le osservazioni fatte ad Antananarivo, Madagascar. L'anno successivo, in un altro breve articolo nella stessa rivista su "Meteorologie de Lourenco Marques" ha rivisto le sue osservazioni per il periodo luglio 1891 a giugno 1901. Nel 1909 le sue osservazioni formarono la base di un articolo tedesco di J. von Hann sul clima di Maputo.