Nasce a Morges nel 1855. Studia teologia a Losanna. Rimpiazza suo fratello Paul Berthoud a Valdezia (Transvaal) quando quest’ultimo rientra in Europa nel 1880. Oltre alle attività missionarie, Henri viaggia, esplora e cartografa, studiando le lingue locali (tonga in particolare) e giungendo fino al Mozambico. Collabora con varie istituzioni europee, fra cui la Società geografica di Neuchâtel. Si occupa di tradurre i testi del Nuovo Testamento in lingua tonga, che vengono pubblicati inizialmente a Losanna poi a Londra. Rimane un dubbio sulla data di morte avvenuta a Valdezia (Transvaal), indicata come 31.12.1904 o 01.01.1905.